6月8日,中國農(nóng)業(yè)科學院作物科學研究所特色農(nóng)作物優(yōu)異種質(zhì)資源發(fā)掘與創(chuàng)新利用團隊,通過對谷子種質(zhì)資源的基因組變異和群體結(jié)構(gòu)分析,組裝了谷子第一個高質(zhì)量圖基因組,系統(tǒng)闡明了谷子起源及馴化改良的過程;對谷子及其野生種青狗尾草的1844份核心種質(zhì)資源進行深入分析,發(fā)掘了1084個重要性狀相關(guān)位點和基因,創(chuàng)制了谷子圖基因組精準高效育種方法,為培育突破性品種提供了理論基礎(chǔ)和技術(shù)路徑。相關(guān)成果發(fā)表在《自然·遺傳學(Nature Genetics)》上。
谷子是我國起源的古老作物,隸屬禾本科狗尾草屬,至今仍是旱作農(nóng)業(yè)的主栽作物,更是應(yīng)對氣候變化和干旱環(huán)境的戰(zhàn)略儲備作物。其籽粒小米營養(yǎng)價值高,深受人們喜愛。作物種質(zhì)資源是優(yōu)異基因的載體,對種質(zhì)資源基因組變異的系統(tǒng)性認識和表型性狀的精準鑒定,有利于其中優(yōu)異基因的發(fā)掘和利用。
論文通訊作者、作科所研究員刁現(xiàn)民表示,基于高覆蓋深度測序,理清了谷子野生種、農(nóng)家品種和現(xiàn)代育成品種的群體結(jié)構(gòu)、分類和衍化關(guān)系,認識到谷子和水稻有著類似的基因組變異水平;群體遺傳學證據(jù)清楚表明谷子單起源,全世界的谷子均來自中國。
中國工程院院士劉旭表示,我國是谷子的起源國,也保存有全世界最多的谷子資源,但系統(tǒng)深入的研究缺乏,限制了其遺傳育種水平的提升。該研究清晰了谷子野生種、農(nóng)家品種和現(xiàn)代育成品種三類資源的基因組變異本底,了解了三類資源的亞群分類和地理分布及其演化的可能過程,從遺傳學上肯定了谷子單起源中心,即中國起源中心的理論,是利用新技術(shù)進行資源研究的典型代表。
中國科學院院士李家洋表示,此次發(fā)表的谷子圖基因組研究,是雜糧領(lǐng)域第一個高質(zhì)量圖基因組。這一工作不僅是谷子研究的又一次“里程碑”式工作,也是對“小作物-大作為”的最好詮釋,并將對其他作物研究具有重要推動作用。
中國科學院院士錢前表示,該研究更清晰地看到了基因組結(jié)構(gòu)變異對發(fā)掘基因功能的重要性,為谷子模式植物體系提供了基因組和表型數(shù)據(jù)基礎(chǔ),全面提升谷子的育種水平和產(chǎn)量品質(zhì)潛力,使我國保持谷子基礎(chǔ)和育種研究的國際領(lǐng)先地位。